Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc85aQ5SP85 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc85aQ5SP85 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms