Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Trappc1Q5NCF2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Trappc1Q5NCF2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Trappc1Q5NCF2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Trappc1Q5NCF2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Trappc1Q5NCF2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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