Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf3Q5HZG4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf3Q5HZG4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms