Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc3lQ4KL14 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms