Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms