Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms