Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm6899Q3USS0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm6899Q3USS0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm6899Q3USS0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm6899Q3USS0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm6899Q3USS0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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