Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmem253Q3UNB8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms