Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms