Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf166Q3U9F6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf166Q3U9F6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf166Q3U9F6 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf166Q3U9F6 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf166Q3U9F6 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf166Q3U9F6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf166Q3U9F6 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf166Q3U9F6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf166Q3U9F6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf166Q3U9F6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rnf166Q3U9F6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rnf166Q3U9F6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf166Q3U9F6 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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