Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Rnf149Q3U2C5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Rnf149Q3U2C5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Rnf149Q3U2C5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Rnf149Q3U2C5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Rnf149Q3U2C5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Rnf149Q3U2C5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Rnf149Q3U2C5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Rnf149Q3U2C5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Rnf149Q3U2C5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Rnf149Q3U2C5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Rnf149Q3U2C5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rnf149Q3U2C5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf149Q3U2C5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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