Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms