Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Tbc1d2bQ3U0J8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Tbc1d2bQ3U0J8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Tbc1d2bQ3U0J8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Tbc1d2bQ3U0J8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Tbc1d2bQ3U0J8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbc1d2bQ3U0J8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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