Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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