Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms