Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbtb38Q3LR78 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms