Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Cers3Q1A3B0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cers3Q1A3B0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cers3Q1A3B0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cers3Q1A3B0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cers3Q1A3B0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cers3Q1A3B0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cers3Q1A3B0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cers3Q1A3B0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cers3Q1A3B0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cers3Q1A3B0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cers3Q1A3B0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms