Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms