Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc21bQ0HA38 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms