Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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