Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox12Q04890 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms