Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms