Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnb1Q03717 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms