Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms