Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ascl1Q02067 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms