Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms