Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms