Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms