Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col8a1Q00780 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms