Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gbp10Q000W5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gbp10Q000W5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms