Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms