Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1bP97358 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms