Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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