Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps5P59438 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms