Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Paxbp1P58501 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Paxbp1P58501 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms