Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Mmp20P57748 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Mmp20P57748 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Mmp20P57748 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Mmp20P57748 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Mmp20P57748 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp20P57748 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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