Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms