Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GferP56213 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GferP56213 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
GferP56213 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
GferP56213 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
GferP56213 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 578.9 ms