Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp1P55194 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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