Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms