Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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