Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TspoP50637 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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TspoP50637 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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TspoP50637 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TspoP50637 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TspoP50637 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms