Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpreP49446 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PtpreP49446 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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