Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms