Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms