Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn11P35235 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms