Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa10P31310 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms