Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxa2P31245 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms