Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CftrP26361 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CftrP26361 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CftrP26361 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CftrP26361 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CftrP26361 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CftrP26361 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CftrP26361 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CftrP26361 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CftrP26361 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CftrP26361 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CftrP26361 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CftrP26361 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CftrP26361 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CftrP26361 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CftrP26361 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CftrP26361 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CftrP26361 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CftrP26361 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CftrP26361 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CftrP26361 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CftrP26361 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CftrP26361 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CftrP26361 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CftrP26361 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CftrP26361 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms