Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms